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Ordinateurs domestiques au service de la recherche

2001/08/26 Kortabarria Olabarria, Beñardo - Elhuyar Zientzia

Un article publié il y a environ un an sur ces mêmes pages intitulé "Tu es aussi chercheur". Nous avons alors parlé du programme Folderol pour rechercher des protéines. Selon ce programme, via le réseau, on pouvait mettre en recherche un ordinateur personnel. Il est devenu célèbre il y a un an, comme déjà fait auparavant avec le projet Seti@home pour découvrir la vie extraterrestre. Aujourd'hui, de nombreux projets de recherche travaillent ainsi.

Fightaids@home http://www.fightaidsathome.com

Comme on le sait, la protéase HIV-1 a une grande influence sur la reproduction des rétrovirus du sida. L'objectif principal de ce programme est d'analyser ce que sont les composés qui peuvent réduire leur impact. En utilisant l'outil informatique AutoDock, ils étudient la structure tridimensionnelle des agents responsables de l'infection. En particulier, AutoDock sert à étudier l'association de petites molécules avec la possibilité d'être des médicaments aux protéines tridimensionnelles.

Le virus du sida a une grande capacité de changement, il faut donc tenir compte de toutes les variantes. C'est pourquoi le travail des ordinateurs qui travaillent ensemble est indispensable.

Compute Against Cancer http://www.computeagainstcancer.org

C'est la première initiative qui a lancé des ordinateurs en réseau pour lutter contre le cancer. Il a été lancé à la fin de l'année dernière. Il permet de travailler avec les systèmes d'exploitation Mac et Windows, avec plus de 16.000 ordinateurs participant à la recherche.

L'objectif principal du programme est d'obtenir de nouveaux médicaments contre le cancer. Pour ce faire, les cellules cancéreuses sont analysées après avoir étudié leurs bases génétiques. Ils étudient également comment les traitements contre le cancer affectent la qualité des patients.

Intel-United Devices Cancer Research Project http://www.ud.com

Alors que ce qui précède était le premier des projets de recherche contre le cancer sur le réseau, si l'on tient compte de la participation, le plus important est le projet United Devices, avec environ 460.000 participants. Fondée et dirigée par la société informatique Intel, elle est soutenue par la National Cancer Research Foundation aux États-Unis et l'Université d'Oxford.

Ce projet utilise le programme Think. En définitive, ce programme réalise des modèles tridimensionnels des molécules à étudier pour effectuer ultérieurement des tests avec celles-ci et avec des protéines. Actuellement, une étude est en cours sur les éléments qui conduisent le sang aux tumeurs, car ils sont censés provoquer la croissance et la prolifération de ceux-ci.

Folding@home http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm

Ce projet analyse les plis des modèles génétiques de protéines. Pour développer le programme de simulation des plis, une nouvelle technique de simulation a été développée qui a permis de réaliser avec succès une simulation représentative du pliage de différentes fractions de protéines et de polymères protéiques synthétiques. Cependant, pour pouvoir travailler avec des protéines réelles, étant plus grandes et complexes, une grande capacité de calcul est nécessaire. C'est pourquoi le travail des ordinateurs qui peuvent travailler ensemble est indispensable. Il peut travailler avec les systèmes d'exploitation Windows et Linux et ont déjà lancé environ 17.000 ordinateurs.

Genome@home http://genomeathome.stanford.edu

L'objectif est de concevoir des gènes capables de former des protéines fonctionnelles en cellules, c'est-à-dire d'élaborer des gènes virtuels. Les promoteurs du projet considèrent que le fonctionnement des gènes peut ainsi être mieux compris. Malgré cet objectif théorique, de nouveaux médicaments et thérapies sont recherchés dans la pratique. Actuellement, environ 20.000 ordinateurs travaillent sur ce projet.

Evolution@home http://www.evolutionary-research.org

Il s'agit d'un projet ambitieux: Approfondir la connaissance de tous les facteurs qui influencent l'évolution des espèces sur Terre. La complexité de l'objectif a conduit à la création de nombreux sous-projets, avec la mise en place de différents simulateurs. Chacun d'eux répondra uniquement à une question concrète. C'est un projet d'avenir, car pour l'instant ils ont lancé un simulateur unique, le simulateur Simulator 005. Son travail consiste à analyser comment elles affectent et comment les transformations génétiques affectent les populations de petite taille.

Golem@home http://www.demo.cs.brandeis.edu/golem

Ce projet propose des études sur la conception de robots et de robots. Des simulations analysent des modes de vie artificiels pour connaître les bases de la vie réelle.

Mars Clicworkers http://clickworkers.arc.nasa.gov

Avec les autres projets de recherche, cela peut être spécial, car il faut plus d'aide que d'ordinateurs connectés au réseau, que d'utilisateurs informatiques qui travaillent sur le réseau. C'est un projet de recherche parce que l'utilisateur d'ordinateur doit marquer les cratères de Mars qu'il voit sur les photos que la NASA envoie à la maison. L'aide est essentielle pour la NASA, qui a pris de nombreuses photos de la couverture de Mars. Pour réduire au maximum le nombre d'erreurs, chaque photo est envoyée à plusieurs personnes.

Selon les responsables du projet, près de 30.000 personnes ont déjà participé, ont marqué plus de 1.800.000 cratères et une base de données de 250.000 cratères a été créée.

Casino 21 http://www.climateprediction.com

Le thème de ce projet est la météorologie. Et c'est que la climatologie a une grande tradition dans l'utilisation de super ordinateurs, car ils ont toujours été utilisés pour faire des prédictions et modéliser le climat qu'ils peuvent simuler. Ils seront utilisés au hasard à partir de données réelles (comme dans les casinos) jusqu'à élaborer des modèles climatiques. Des modèles tridimensionnels seront construits sur l'ordinateur, en tenant compte de diverses variables qui composent le climat, comme les pluies, les températures, le comportement des gaz qui provoquent l'effet de serre, l'état de la mer, etc. L'objectif principal est d'élaborer des modèles climatiques qui servent pour ce siècle. Le projet a été annoncé, mais il n'y a pas encore de participation, car il est à ses débuts.

Gamma Flux http://www.jansson.net

Programme d'amélioration des conteneurs et systèmes de collecte des déchets radioactifs utilisés. Les conteneurs émetteurs de rayonnement sont simulés pour calculer la quantité de rayonnement gamma qui sort des conteneurs. Logiquement, ce processus a beaucoup à voir, entre autres, la forme, les dimensions et la structure du conteneur.

Particle Physics Data Grid http://www.cacr.caltech.edu/ppdg

Son objectif est de réaliser des études de physique des particules en utilisant le calcul informatique distribué. Les principales organisations mondiales participeront en matière de physique des particules et seront mises en place prochainement.

Voici quelques-uns des projets les plus importants en cours de recherche en réseau. Il existe d'autres importants comme Seti@home ou Folderol lui-même, mais aussi d'autres plus petits: Projet Gimps, Projet Distributed.net, Projet Mindpixel, Projet SaferMarkets, etc. Certains ont du temps sur le net, d'autres sont presque nouveaux, certains ont de grands objectifs, d'autres sont plus simples… le réseau unit les ordinateurs de chacun d'entre nous.

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