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Ordenadores domésticos al servicio de la investigación

2001/08/26 Kortabarria Olabarria, Beñardo - Elhuyar Zientzia

Un artículo publicado hace aproximadamente un año en estas mismas páginas titulamos "Tú
también eres investigador". Entonces hablamos del programa Folderol para investigar proteínas. Según este programa, a través de la red se podía poner en investigación un ordenador personal. Él se hizo famoso hace un año, como ya se hizo antes con el proyecto Seti@home para descubrir la vida alienígena. Hoy en día, en muchos proyectos de investigación se trabaja así.

Fightaids@home http://www.fightaidsathome.com

Como es sabido, la proteasa HIV-1 tiene una gran influencia en la reproducción de los retrovirus del sida. El objetivo principal de este programa es analizar en qué consisten los compuestos que pueden reducir su impacto. Utilizando la herramienta informática AutoDock, investigan la estructura tridimensional de los agentes causantes de la infección. En concreto, el AutoDock sirve para estudiar la asociación de moléculas pequeñas con posibilidad de ser medicamentos a proteínas tridimensionales.

El virus del sida tiene una gran capacidad de cambio, por lo que hay que tener en cuenta todas las variantes. Por ello, es imprescindible el trabajo de los ordenadores que trabajan juntos.

Compute Against Cáncer http://www.computeagainstcancer.org

Se trata de la primera iniciativa que puso en marcha ordenadores en red para luchar contra el cáncer. Se puso en marcha a finales del año pasado. Permite trabajar con los sistemas operativos Mac y Windows, con más de 16.000 ordenadores participando en la investigación.

El objetivo principal del programa es la obtención de nuevos medicamentos contra el cáncer. Para ello, se analizan las células cancerosas tras estudiar sus bases genéticas. También investigan cómo los tratamientos contra el cáncer afectan a la calidad de los pacientes.

Intel-United Devices Cancer Research Project http://www.ud.com

Si bien lo anterior fue el primero de los proyectos de investigación contra el cáncer en la red, si se tiene en cuenta la participación, lo más importante es el proyecto United Devices, con cerca de 460.000 participantes. Fundada e impulsada por la empresa informática Intel, cuenta con el apoyo de la Fundación Nacional de Investigación del Cáncer de Estados Unidos y la Universidad de Oxford.

En este proyecto se está utilizando el programa Think. En definitiva, este programa realiza modelos tridimensionales de las moléculas a estudiar para realizar posteriormente pruebas con éstas y con proteínas. En la actualidad se está realizando un estudio de los elementos que conducen sangre a los tumores, ya que se cree que provocan el crecimiento y la proliferación de los mismos.

Folding@home http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm

En este proyecto se analizan los pliegues de los modelos genéticos de proteínas. Para desarrollar el programa de simulación de pliegues se ha desarrollado una nueva técnica de simulación que ha permitido realizar con éxito una simulación representativa del plegado de diferentes fracciones de proteínas y polímeros proteicos sintéticos. Sin embargo, para poder trabajar con proteínas reales, al ser más grandes y complejas, se requiere una gran capacidad de cálculo. Por eso, el trabajo de los ordenadores que pueden trabajar juntos es imprescindible. Puede trabajar con los sistemas operativos Windows y Linux y ya han puesto en marcha cerca de 17.000 ordenadores.

Genome@home http://genomeathome.stanford.edu

El objetivo es diseñar genes capaces de formar proteínas funcionales en células, es decir, elaborar genes virtuales. Los impulsores del proyecto consideran que así se podrá entender mejor el funcionamiento de los genes. A pesar de este objetivo teórico, en la práctica se buscan nuevos fármacos y terapias. En la actualidad alrededor de 20.000 ordenadores están trabajando en este proyecto.

Evolution@home http://www.evolutionary-research.org

Se trata de un proyecto ambicioso: Profundizar en el conocimiento de todos los factores que influyen en la evolución de las especies en la Tierra. La complejidad del objetivo ha llevado a la creación de numerosos subproyectos, con la puesta en marcha de diferentes simuladores. Cada uno de ellos responderá únicamente a una pregunta concreta. Esto es un proyecto de futuro, ya que por el momento han puesto en marcha un único simulador, el simulador Simulator 005. Su trabajo consiste en analizar cómo afectan y cómo afectan las transformaciones genéticas en poblaciones de pequeño tamaño.

Golem@home http://www.demo.cs.brandeis.edu/golem

En este proyecto se realizan estudios sobre el diseño de robots y robots. Mediante simulaciones se analizan formas de vida artificiales para conocer las bases de la vida real.

Mars Clicworkers http://clickworkers.arc.nasa.gov

Junto al resto de proyectos de investigación, esto puede ser especial, ya que se necesita más ayuda que de ordenadores conectados a la red, que de usuarios de ordenador que trabajan en la red. Se trata de un proyecto de búsqueda porque el usuario de ordenador tiene que marcar los cráteres de Marte que ve en las fotos que la NASA envía a casa. La ayuda es fundamental para la NASA, que ha sacado muchas fotos de la portada de Marte. Para reducir al máximo el número de errores, cada foto se envía a varias personas.

Según los responsables del proyecto, ya han participado cerca de 30.000 personas, han marcado más de 1.800.000 cráteres y se ha creado una base de datos de 250.000 cráteres.

Casino 21 http://www.climateprediction.com

El tema de este proyecto es la meteorología. Y es que la climatología tiene una gran tradición en el uso de super ordenadores, ya que siempre se han utilizado para hacer predicciones y modelizar el clima que pueden simular. Se utilizarán aleatoriamente a partir de datos reales (como en los casinos) hasta elaborar modelos climáticos. En el ordenador se construirán modelos tridimensionales, teniendo en cuenta diversas variables que componen el clima, como son las lluvias, las temperaturas, el comportamiento de los gases que provocan el efecto invernadero, el estado del mar, etc. El objetivo principal es elaborar modelos climáticos que sirvan para este siglo. El proyecto se ha anunciado pero todavía no hay participación, ya que está en sus inicios.

Gamma Flux http://www.jansson.net

Programa de mejora de los contenedores y sistemas de recogida de residuos radiactivos utilizados. Se simulan los contenedores emisores de radiación para calcular la cantidad de radiación gamma que sale de los contenedores. Lógicamente, en este proceso tienen mucho que ver, entre otras cosas, la forma, dimensiones y estructura del contenedor.

Particle Physics Data Grid http://www.cacr.caltech.edu/ppdg

Su objetivo es realizar estudios de física de partículas utilizando el cálculo informático distribuido. Participarán las principales organizaciones mundiales en materia de física de partículas y se pondrá en marcha próximamente.

Estos son algunos de los proyectos más importantes que se están desarrollando actualmente en investigación en red. Existen otros importantes como el ya mencionado Seti@home o el propio Folderol, pero también otros más pequeños: Proyecto Gimps, Proyecto Distributed.net, Proyecto Mindpixel, Proyecto SaferMarkets, etc. Algunos llevan tiempo en la red, otros son casi nuevos, algunos tienen grandes objetivos, otros son más sencillos… la red une los ordenadores de cada uno de nosotros.

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