AA tresnak

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Le foyer des bactéries

L'Institut d'agrotechnologie du NUP étudie la façon dont les bactéries créent leur lieu de résidence, le biofilm.

AA tresnak

Un organisme unicellulaire sans noyau. C'est-à-dire, par définition, une bactérie. Bien qu'il soit microscopique, son mode de vie est beaucoup plus complexe qu'on ne le pense car, comme les fourmis, les abeilles ou les humains, il vit dans la communauté ou dans les colonies. Pour ce faire, il crée le biofilm, c'est-à-dire la résidence. Il grandit collé à n'importe quelle surface, et cette structure est très difficile à défaire.
Le revêtement coulissant qui se forme sur les pierres des ruisseaux, la substance visqueuse que nous voyons à l'intérieur du tube ou le film qui nous salit les dents tous les jours sont un biofilm composé de bactéries. La connaissance des mécanismes des
bactéries pour la culture des biofilms microbiens est l'une des lignes de recherche de l'équipe de l'Institut d'Agrotechnologie de l'Université Publique de Navarre. L'objectif est de détruire ces colonies qui sont à l'origine de l'infection ou d'encourager la croissance là où elle est nécessaire.

INONDE LASA ; NUP : Notre recherche est très moléculaire. Nous essayons de découvrir quels gènes la bactérie utilise pour le faire, quelle est la structure chimique, et le but ultime serait de détruire un biofilm déjà fait, ou d'essayer d'éviter la production d'un biofilm qui n'est pas encore fait...
Si une personne reçoit une prothèse, nous ne voulons pas qu'elle ajoute des bactéries à cette prothèse et que le biofilm soit fait, parce que cela entraînerait une infection, la prothèse doit être enlevée...

Pour être la matière première de la recherche, ils adoptent des bactéries isolées de la nature. Afin d'assurer leur capacité de production de biofilm, il est nécessaire de créer des conditions appropriées dans le laboratoire.

INONDE LASA ; NUP : Quand nous inventons comment cette bactérie fait du biofilm en laboratoire, nous essayons de découvrir quels gènes cette bactérie a besoin pour faire du biofilm. Pour ça, on fait des mutations, on retire les gènes...

La mutation de l'ensemble du génome peut éliminer la capacité de production du biofilm, mais les chercheurs veulent savoir à quel genre cette capacité est liée pour pouvoir la contrôler.

Les bactéries et leurs mutations sont placées dans les puits des plaquettes. Ils restent jusqu'à la réalisation du biofilm. Ensuite, les résultats sont teints et on voit s'ils ont fait un biofilm ou s'ils ont perdu cette capacité.

INONDE LASA ; NUP : Une autre façon serait de le faire sur des plaques. Nous avons découvert que la façon dont les bactéries se développent dans les plaquettes est liée à la capacité de production du biofilm. Ici, par exemple, il y a deux bactéries. Il y a très peu de différence entre les deux bactéries, il y a une différence dans un nucléotide entre les deux. Ce serait la mère, et ça c'est un mutant, un mutant dont on a modifié un nucléotide, et le seul changement de ce nucléotide -- cette bactérie a changé 3 millions de nucléotides et seulement un -- et c'est ce changement qui rend la bactérie incapable de faire un biofilm, et la plaque montre une colonie très différente.

Une mutation intéressante est sélectionnée et la capacité de faire du biofilm dans les fermenteurs est assurée.

JAIONE VALLE; CSIC : Ce sont les microfermentateurs. C'est le système de création de biofilm. D'une part, le média est introduit et d'autre part, le supplément est extrait.

Nous lui inculquons la culture. Ce sont des bactéries qui poussent dans le tube à essai et que nous mettons dans le microfermenteur. Au début, la spatule est propre. après 24 heures, il y a le biofilm. Les bactéries se sont attachées à la spatule, se sont multipliées, ont jeté de l'exopolysaccharide et ont produit ensemble un biofilm.

Toutes les bactéries vivant dans une colonie ne remplissent pas la même fonction. Il existe une spécialisation, qui peut être la clé de la capacité à produire un biofilm.
Pour différencier les caractéristiques des gènes bactériens qui peuvent être des mutants utiles pour la recherche, il est nécessaire de recourir à la microscopie.

INONDE LASA ; NUP : Certains font certaines choses, d'autres font d'autres choses, et c'est ce que nous apprenons au microscope, et c'est pour cela que nous utilisons des gènes "mouchards" de différentes couleurs. chaque "lanceur d'alerte" allume une couleur différente, et c'est en regardant ces couleurs que nous nous rendons compte, toi ?? il y a des bactéries qui font une chose, d'autres une autre. Le travail part.

ALEJANDRO TOLEDO; CSIC: Ils marquent un gène d'une couleur et l'autre d'une autre. Ici, nous pouvons voir que dans cette population bactérienne, la plupart des bactéries apparaissent en vert, mais il y en a quelques-unes qui apparaissent en rouge.

Il est important de connaître la variabilité de la population. Souvent, c'est pourquoi les traitements ne fonctionnent pas. Nous pensons que toutes les bactéries d'une population sont les mêmes et que le traitement devrait les tuer toutes, et ce n'est pas le cas.

CRISTINA LATASA ; NUP : Lorsque nous avons découvert la mutation d’un gène qui l’empêche de produire un biofilm, il est nécessaire de faire des tests qui imitent les conditions réelles, c’est-à-dire in vivo. Par exemple, avec les cathéters.

Ils font des tests sur les rats. Ils mettent le cathéter sous la peau et le contaminent avec des bactéries. L'un est infecté par la bactérie de la souche sauvage et l'autre par le mutant. Après deux ou trois jours, ils récupèrent les cathéters, examinent les biofilms qui ont été produits et voient s'ils ont des différences notables.

Les biofilms sont les lieux de vie et de protection des bactéries. La découverte de médicaments ou de drogues qui décomposent ces biofilms ou qui privent les bactéries de la capacité de produire des biofilms est très importante pour éviter de nombreux cas d'infection et de contamination.