Técnica de elaboración máis rápida do mapa xenético

2001/06/11 Galarraga Aiestaran, Ana - Elhuyar Zientzia

• Genetika
• Softwarea

Paira a procura de xenes relacionados con enfermidades, os investigadores utilizan habitualmente ratos de laboratorio, que proporcionan medicións máis nítidas que os humanos. Ao crecer centos ou miles de ratos buscan indicadores xenéticos relacionados con características como a obesidade ou o alto nivel de colesterol. Os modelos de asociación permiten identificar determinadas partes do xenoma do rato asociadas á característica. A consecución deste resultado, con todo, é un traballo moi pesado e longo que require de anos paira coñecer a situación aproximada dun xene.

Agora, Gary Peltz e o seu equipo presentaron a forma de acelerar o proceso. Os investigadores recolleron en 15 variedades de rato una base de datos con 3.000 indicadores xenéticos denominados polimorfismos mononucleótidos (SNP). Posteriormente inventouse un algoritmo paira localizar as características. Paira iso, os investigadores buscaron una característica concreta en cada variedade de rato (por exemplo, o nivel de colesterol) e viron como variaba segundo a variedade. Posteriormente, o algoritmo analizou os pares de variedades e buscaba os mesmos modelos de SNP entre os fenotipos similares. A maior variedade de variedades analizadas, maior predición.

Paira probar a eficacia do algoritmo introducíronse no programa datos de 10 características coñecidas, entre elas a densidade ósea e a tendencia ao consumo de alcol. Posteriormente, comparáronse os espazos proporcionados polo computador co mapa obtido co método tradicional e observouse que coincidían nun 75%.

Este resultado aínda non é tan satisfactorio como se esperaba, polo que seguirán traballando na súa mellora. Con todo, creen que algún día servirá paira localizar rapidamente mutacións que explican as diferenzas entre os fenotipos.