Les algorithmes d'analyse linguistique servent à prédire les mutations de virus

2021/01/18 Etxebeste Aduriz, Egoitz - Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

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À partir des similitudes conceptuelles dans l'évolution des langues et des virus, les chercheurs du MIT ont développé un outil pour prévoir des mutations de virus. Il peut être un outil utile pour prévoir les mutations que les virus peuvent développer pour échapper au système immunitaire ou aux vaccins. Le travail a été publié dans la revue Science.

Sur la base des concepts linguistiques «grammaire» (ou syntaxe) et «sens» (ou sémantique), les chercheurs ont utilisé une technique de traitement linguistique. Cette technique est utilisée pour l'apprentissage des langues par les machines, mais dans ce cas les séquences de mots ont été remplacées par une des acides aminés. En fait, comme on conserve la grammaire (structure) d'une phrase en changeant les mots, mais on peut changer la signification, par mutations les virus peuvent maintenir la structure et la capacité infectieuse, mais changer la sémantique du virus de façon à ne pas connaître les anticorps. Et ce nouvel outil sert à prévoir quelles options il y a pour le faire.

Les modèles ont été développés pour la grippe A, le VIH et le SARS-CoV-2 et, selon les chercheurs, ont annoncé avec précision les mutations qui peuvent servir d'échappement et ont déterminé les zones structurelles à fort potentiel de fuite. Dans le cas de SARS-CoV2, par exemple, ils ont vu que toute la capacité de fuite de la protéine spike (celle qui utilise le virus pour l'introduire dans la cellule) se trouve dans deux des trois domaines de cette protéine.