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Los algoritmos de análisis de idiomas sirven para predecir mutaciones de virus

2021/01/18 Etxebeste Aduriz, Egoitz - Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

Proteína de spike del virus SARS-CoV-2.

A partir de las similitudes conceptuales en la evolución de las lenguas y los virus, los investigadores del MIT han desarrollado una herramienta para prever mutaciones de virus. Puede ser una herramienta útil para prever las mutaciones que los virus pueden desarrollar para escapar al sistema inmunitario o a las vacunas. El trabajo ha sido publicado en la revista Science.

Basándose en los conceptos lingüísticos “gramática” (o sintaxis) y “significado” (o semántica), los investigadores han utilizado una técnica de procesamiento lingüístico. Esta técnica se utiliza para el aprendizaje de idiomas por parte de las máquinas, pero en este caso las secuencias de palabras han sido sustituidas por una de aminoácidos. De hecho, al igual que se conserva la gramática (estructura) de una frase cambiando las palabras, pero se puede cambiar el significado, mediante mutaciones los virus pueden mantener la estructura y la capacidad infecciosa, pero cambiar la semántica del virus de forma que no se conozcan los anticuerpos. Y esta nueva herramienta sirve para predecir qué opciones hay para hacerlo.

Los modelos han sido desarrollados para la Gripe A, el VIH y el SARS-CoV-2 y, según los investigadores, han anunciado con precisión las mutaciones que pueden servir de escape y han determinado las zonas estructurales con un alto potencial de fuga. En el caso de SARS-CoV2, por ejemplo, han visto que toda la capacidad de fuga de la proteína spike (la que utiliza el virus para introducirla en la célula) se encuentra en dos de los tres dominios de dicha proteína.

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