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Nouveaux défis en biociences

2003/09/01 Agirre Ruiz de Arkaute, Aitziber - Elhuyar Zientzia | Rementeria Argote, Nagore - Elhuyar Zientziaren Komunikazioa Iturria: Elhuyar aldizkaria

La santé et, en général, les biociences orienteront la technologie dans les années à venir. C'est ce qu'estiment au moins la plupart des gouvernements européens, et sur cette base ont décidé les stratégies générales de recherche. En Euskal Herria, on a encore peu fait, il suffit de le voir quant aux produits sanitaires, il existe une dépendance presque totale de l'extérieur. C'est pourquoi le Gouvernement basque a décidé quels sont les nouveaux secteurs à promouvoir pour assurer le développement futur de la santé et des biociences. Participants aux projets: Le prochain défi de la biologie: Protéomique ! Bioinformatique, un outil indispensable
(Photo: Gaiker).

Deux centres de promotion et de coordination de projets liés aux biosciences seront construits. L'un d'eux sera situé dans le parc technologique du Zamudio, en Biscaye, et sera chargé de coordonner le projet appelé BIOGUNE, un projet sur la santé et la biopharmacologie. Le deuxième centre sera situé à Saint-Sébastien, dans le parc technologique de Miramón, et promouvra des recherches sur les biomatériaux à travers le projet MAAB.

Tous ces projets sont coordonnés par la Société pour la Promotion et la Reconversion Industrielle du Gouvernement Basque. Selon Maria Agirre Biobask, responsable de l’agence, « l’objectif de ces centres de coopération est clair : coordonner et exploiter nos ressources. Pour cela, nous unifierons tous les agents dans des noyaux géographiques. Nous sommes peu nombreux, mais nous devons exploiter le potentiel.» En outre, ils ont pour objectif de créer 3.000 nouveaux emplois dans le domaine des biociences pour l'année 2010. Mais pas sur n'importe quel sujet.

Pour la formation des os, des matériaux poreux sont utilisés comme support. (Photo: N. Forge).

Selon Maria, « les brevets et créatrices de nouvelles entreprises ou celles qui sont exploitées commercialement seront promus ». Ainsi, les domaines qui veulent renforcer ont été classés dans trois programmes: d'une part, génomique, protéomique et biopharmacologie; d'autre part, biomatériaux; et enfin, projets liés à la sécurité alimentaire.

Toutes sont importantes. Certains ont été sélectionnés pour être stratégiques dans la recherche mondiale. D'autres, cependant, parce que dans Euskal Herria il ya un besoin ou une force spéciale.

Biomatériaux

La recherche sur les biomatériaux est très importante à la Fondation Inasmet. (Photo: N. Forge.

En médecine, l'introduction de matériaux synthétiques à l'intérieur du corps, tels que les prothèses ou les stimulateurs cardiaques, est de plus en plus fréquente. Ces matériaux ne doivent pas produire des réactions allergiques ou autres dans le corps, c'est-à-dire doivent être biocompatibles. Ils sont biomatériaux.

Étant donné que la technologie des biomatériaux, l'ingénierie tissulaire et la nanobiotechnologie vont jouer un rôle important, ils vont désormais aborder différents projets. Tout d'abord, nous travaillons sur la régénération des tissus. Ils étudient les biomatériaux capables de régénérer l'os, le cartilage, la peau, la cornée et d'autres organes et tissus. D’après Goyo Ortiz d’Urbina, chercheur d’Inasmet et responsable principal de projets en biomatériaux de Biobask, ils étudient également des matériaux bioactifs, « non seulement pour remplacer un élément endommagé, mais aussi des matériaux fonctionnellement actifs, biocompatibles, bioactifs et biomimétiques, comme la réalisation de prothèses ».

Avec l'utilisation de biomatériaux, Inasmet développe des prothèses du genou. (Photo: N. Forge).

Des biocapteurs sont également en cours de développement qui informeront sur le fonctionnement du biomatérial incorporel, de petits appareils ou dispositifs qui analysent l'adéquation de la compatibilité de ce matériel avec les tissus. Ces capteurs permettront aux médecins de surveiller le fonctionnement du biomatérial.

En outre, ils visent le développement de micro-caméras très utiles dans les opérations chirurgicales. Son objectif est de développer de petits instruments pour minimiser l'impact opérationnel.

Maria Agirre est responsable de Biobask. (Photo: A. Agirre).

Mais les biomatériaux ont également d'autres applications. Par exemple, ils sont utilisés pour améliorer le dosage des médicaments. En fait, les médicaments doivent couler en très petites quantités et à un certain organe corporel. Par conséquent, il est nécessaire de concevoir un biomatérial de revêtement approprié qui se dissout à l'endroit approprié.

Génomique et protéomique

La résolution du génome humain ces dernières années va grandement limiter la direction de la médecine de ce siècle. La connaissance du génome permettra de prédiagnostiquer des maladies génétiques et de connaître le risque génétique de chaque personne pour le développement de différentes maladies. L'un des objectifs de la génomique est de rendre habituelles les analyses génétiques pour les soins de santé, ce que le Gouvernement basque a voulu introduire comme thème stratégique.

Cependant, la génomique a ouvert ses portes à un autre domaine de recherche très important: la protéomique. C'est probablement le domaine qui se consacre le plus à la biologie. La protéomique étudie non des gènes mais des protéines, car ce sont les responsables des maladies.

Il est à espérer que la collaboration entre universités, entreprises et hôpitaux donnera de bons résultats à l'avenir.

Plusieurs projets seront financés au sein de la protéomique. Certains d'entre eux seront réalisés dans l'Unité de Biophysique, située à l'Université du Pays Basque. D'une part, ils étudieront comment se plient les protéines, car leur activité en dépend. Les protéines mal pliées produisent souvent des maladies, de sorte que des projets liés au mauvais pli des protéines, des maladies neurodégénératives et cardiovasculaires seront développés.

Cependant, pour le moment, les techniques à utiliser en protéomique ne sont pas entièrement développées, de sorte que des outils logiciels et matériels seront développés qui seront utiles pour l'étude du pliage et la caractérisation des protéines, coordonnées par le Département de chimie physique de l'UPV/EHU. D'une part, on essaie de concevoir des programmes adaptés pour prédire le pliage des protéines et, d'autre part, développer de nouveaux spectromètres MALDI-TOF plus précis utilisés en protéomique. Ce sont des zones très déficitaires en Euskal Herria et dans le monde en général.

Neurosciences et oncologie

Dans ces projets, de grands efforts sont faits pour stimuler la recherche dans les hôpitaux.

Dans le projet Biobask seront également promues des recherches sur le cancer. Le cancer est l'ensemble de nombreuses maladies, mais son incidence sur la population est élevée, il faut donc enquêter. Jusqu'à présent, au Pays basque, peu de recherches ont été menées sur le cancer. Biobask, cependant, encouragera des projets pour leur intérêt pour le système de santé.

D'autre part, un effort spécial sera fait sur les neurosciences. Selon Maria Agirre elle-même, « certaines maladies liées au système nerveux sont de plus en plus fréquentes. De plus, comme nous vivons dans une société vieillissante, ce sera un type de maladie qui suscite une grande préoccupation ». C'est pourquoi le Gouvernement basque va allouer des fonds pour la recherche de maladies neurodégénératives. La base biologique de ces maladies et leur guérison éventuelle seront analysées. En fait, à l'Université du Pays Basque, ils étudient ce type de recherche depuis des années et collaborent aussi bien avec des hôpitaux d'Osakidetza qu'avec des entreprises biotechnologiques.

Ce dernier est un autre objectif du projet Biobask 2010: promouvoir la recherche scientifique dans les hôpitaux. Selon Maria, « dans les hôpitaux, la recherche se trouve dans une situation compliquée, dans le but d’avoir la même importance que celle accordée aux soins et à la gestion des patients. Il faut surtout collaborer avec les autres chercheurs. En fait, ceux qui effectuent des recherches de base dans les universités ont besoin de l'assistance médicale, qui ont des échantillons et des dossiers cliniques de patients. Ils ne pourront pas connaître l'influence des nouveaux médicaments qu'ils ont développés. Et la même chose pour les médecins : ils ne pourront pas effectuer d’essais cliniques sans les recherches et les essais de base que les chercheurs doivent réaliser avant leur réalisation. »

Autres maladies

Le développement des biosciences semble imparable.

Jusqu'à présent, des antibiotiques ont été utilisés pour traiter les maladies ou les infections produites par des bactéries, mais cette méthode offre déjà peu de nouveaux résultats. Ainsi, à l'Université du Pays Basque/Euskal Herriko Unibertsitatea, des recherches sont en cours qui permettront de nouveaux traitements, car il existe des groupes de recherche avec de nombreuses années d'expérience. L'unité de biophysique, par exemple, enquête sur les mécanismes de toxicité et d'infection des virus et des bactéries. Il s'agit de comprendre l'activité des toxines produites par les bactéries pour étudier l'ouverture des membranes cellulaires et pouvoir développer à l'avenir des médicaments et des vaccins contre elles.

Biobask encouragera également de manière significative les recherches sur les maladies auto-immunes et prépare également des kits spéciaux pour diagnostiquer les maladies fongiques. Il s'agit, dans une large mesure, de projets qui joueront un rôle important dans les biosciences.

Participants au projet BIOGUNE:

  • AZTI
  • CIDETEC
  • INBIOMED
  • CEIT
  • GAIKER
  • LEIA
  • CIC BIOGUNE
  • IKERLAN
  • NEIKER

UPV-EHU (Département des Sciences de l'Informatique et de l'Intelligence Artificielle; Département de Biologie Animale et Génétique; Département de Biochimie et de Biologie Moléculaire; Département de Pharmacie et Technologie Pharmaceutique; Département de Physiologie; Département d'Immunologie, de Microbiologie et de Parasitologie; Département de Chimie; Département de Chimie; Département de Chimie; Département de Département de Département de Chimie; Unité Département de Chimie; Département de Département de Département de Département de Département de Chimie; Département de Chimie; Département de Système; Département de Département de Chimie; Département de Unité; Département de Physique de Département de Physique de Département de Système; Département de Chimie; Département de Département de Unité;

Participants au projet MAAB:

  • AZTI
  • INASMET

CIC biomat et produits sanitaires UPV (POLYMAT)

  • CIDETEC

Après le séquençage du génome humain, une nouvelle zone de travail acquiert une grande force : la protéomique. La protéomique étudie la protéome, c'est-à-dire l'ensemble de toutes les protéines qui sont formées à partir d'un génome.

Après le séquençage du génome humain, il est maintenant nécessaire de clarifier l'information trouvée, de sorte que les protéines sont le nouvel objectif des chercheurs. Il faut clarifier la structure et la fonction des protéines, qui sont les vrais travailleurs de la cellule, qui en quelque sorte respectent les ordres écrits dans les gènes. Et si ces protéines sont défectueuses ou sont en quantités insuffisantes, alors les maladies se produisent. Les exemples sont nombreux: Maladie d'Alzheimer, maladie des vaches folles... Les protéines sont directement impliquées dans des processus pathologiques. Il est donc très important de savoir comment sont les protéines et dans quels cas les maladies se produisent. En d'autres termes, rechercher quels modèles de protéines sont maintenus dans chaque maladie.

Jusqu'à présent, des recherches ont été menées autour des protéines, mais en analysant les protéines séparément; en protéomique, on étudie à une échelle beaucoup plus grande, comme dans la génomique, des centaines de gènes sont séquencés. Il s'agit, par exemple, d'analyser toutes les interactions métaboliques de chaque protéome.

Aujourd'hui, de nombreuses lignes de recherche, comme la protéomique ou la génomique, collectent d'innombrables données. Pour faciliter la collecte et l'interprétation correcte de toutes ces données, il est nécessaire d'utiliser des programmes informatiques complexes. Ce travail si concret a donné lieu à un outil qui combine biologie, informatique et technologie : la bioinformatique.

Par exemple, des mois étaient nécessaires pour séquencer un gène, mais des centaines de gènes sont séquencés aujourd'hui. La bioinformatique est indispensable pour interpréter toutes ces données.

C'est pourquoi la bioinformatique a connu de grandes avancées au cours de la dernière décennie et doit en même temps continuer à se développer pour que d'autres domaines tels que la médecine légale, l'anthropologie, le contrôle des ravageurs, la création d'organismes génétiquement modifiés… sont de plus en plus les applications qui profitent des avantages de la bioinformatique.

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