A secuenciación de ADN con nanoporo dá os seus primeiros resultados

2012/04/01 Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

• Teknologia
• Genetika

Os investigadores de Oxford Nanopore Technologies presentaron os primeiros resultados obtidos cun dispositivo de secuenciación de ADN pasando por un nanoporo. Segundo eles, con este dispositivo poderase secuenciar un xenoma humano completo en 15 minutos.

A idea é antiga, dos 90. O ADN faise pasar por un nanoporo proteico integrado nunha membrana. A través do nanoporo flúe a corrente eléctrica e cada base de ADN produce una variación diferente en dita corrente. A medición destes cambios permite coñecer a secuencia do ADN que pasa polo nanoporo.

Esta técnica ten varias vantaxes. Por unha banda, require moito menos traballo preparatorio do habitual; entre outras cousas, non é necesario amplificar o ADN, basta con polo nunha solución. Doutra banda, secuencia e en tempo real filamentos moito máis longos que os secuenciadores actuais. Ademais, non afecta ao ADN secuenciado e déixao en condicións de realizar máis análises.

A posta a piques da técnica tardou uns vinte anos, pero os de Oxford conseguírono: Coa secuenciadora chamada GridION, secuencian o xenoma do bacteriófago Phi X. O lanzamento de GridION comezará a partir da metade do ano, coa intención de comercializar una versión miniaturizada (tamaño USB) e barata (uns 700 euros) denominada MinION.

A primeira versión de Gridion terá 2.000 nanoporos, pero paira o próximo ano prevese sacar 8.000. Ademais, os dispositivos pódense unir entre si e con 20 dispositivos de 8.000 nanoporos sería posible secuenciar un xenoma humano en 15 minutos.

Con todo, o secuenciador ten un punto débil: Ten un erro do 4%, é dicir, le incorrectamente 4 de cada 100 nucleótidos. Con todo, os investigadores sinalan que o obxectivo é reducir este erro de comercialización entre 0,1 e 1%.