La secuenciación de ADN con nanoporo da sus primeros resultados
2012/04/01 Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria
Los investigadores de Oxford Nanopore Technologies han presentado los primeros resultados obtenidos con un dispositivo de secuenciación de ADN pasando por un nanoporo. Según ellos, con este dispositivo se podrá secuenciar un genoma humano completo en 15 minutos.
La idea es antigua, de los 90. El ADN se hace pasar por un nanoporo proteico integrado en una membrana. A través del nanoporo fluye la corriente eléctrica y cada base de ADN produce una variación diferente en dicha corriente. La medición de estos cambios permite conocer la secuencia del ADN que pasa por el nanoporo.
Esta técnica tiene varias ventajas. Por un lado, requiere mucho menos trabajo preparatorio de lo habitual; entre otras cosas, no es necesario amplificar el ADN, basta con ponerlo en una solución. Por otro lado, secuencia y en tiempo real filamentos mucho más largos que los secuenciadores actuales. Además, no afecta al ADN secuenciado y lo deja en condiciones de realizar más análisis.
La puesta a punto de la técnica ha tardado unos veinte años, pero los de Oxford lo han conseguido: Con la secuenciadora llamada GridION, secuencian el genoma del bacteriófago Phi X. El lanzamiento de GridION comenzará a partir de la mitad del año, con la intención de comercializar una versión miniaturizada (tamaño USB) y barata (unos 700 euros) denominada MinION.
La primera versión de Gridion tendrá 2.000 nanoporos, pero para el próximo año se prevé sacar 8.000. Además, los dispositivos se pueden unir entre sí y con 20 dispositivos de 8.000 nanoporos sería posible secuenciar un genoma humano en 15 minutos.
Sin embargo, el secuenciador tiene un punto débil: Tiene un error del 4%, es decir, lee incorrectamente 4 de cada 100 nucleótidos. Sin embargo, los investigadores señalan que el objetivo es reducir este error de comercialización entre 0,1 y 1%.
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