Frit, cuit, rôti... et enfin séquencé

2011/09/01 Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

• Genetika
• Botanika

L'effort conjoint de 26 centres de recherche à travers le monde a permis de séquencer le génome de la pomme de terre. Comme le riz, le blé et le maïs, la pomme de terre est l'un des aliments de base du monde, mais jusqu'à présent ils n'ont pas pu décoder leur génome, car c'est une espèce très complexe génétiquement.

La pomme de terre a 39.000 gènes codeurs et est tétraploïde, c.-à-d., chaque cellule a 4 copies de chaque chromosome. En outre, un degré élevé d'hétérozéroception apparaît généralement, c'est-à-dire qu'il existe de nombreuses différences entre les quatre copies. Les différences peuvent être, par exemple, l'apparition de certains gènes et dans d'autres pas. C'est pourquoi il est très difficile de séquencer complètement le génome de la pomme de terre.

Conscients de cette complexité intrinsèque des pommes de terre conventionnelles, les chercheurs ont cherché une variété avec un génome plus simple afin qu'ils puissent le simplifier davantage. Il a choisi une variété qui pousse en Amérique du Sud, qui a été appelé DM, contrairement aux autres pommes de terre, qui contient le génome diploïde (deux copies de chaque chromosome). De là, il a pris une des deux copies de chaque chromosome et plié. De cette façon, il s'est assuré que les deux copies étaient identiques et alors oui, elles ont pu être séquencées presque entièrement.

Le principal résultat obtenu dans la première analyse a été la recherche de 800 gènes dans le génome de la pomme de terre qui les rendent résistants aux maladies. Les résultats ont été publiés dans la revue Nature.