Detecció genètica de nous virus patògens

2000/02/01 Arrese, Elixabete | Basaras, Miren - Mikrobiologiako Irakasle Titularra Iturria: Elhuyar aldizkaria

• Genetika

Tots tenim el risc de sofrir alguna transfusió de sang de tant en tant. Sempre esperem que aquesta sang sigui “neta”, és a dir, sense microorganismes. En els últims anys s'estan identificant cada vegada més nous microorganismes, alguns dels quals es transporten amb relativa facilitat gràcies a la sang. En ells hi ha alguns que produeixen hepatitis, com el virus de l'hepatitis C (CHB), el virus de l'hepatitis G (GHB) i l'acabat de descobrir TTV o “Transfusion-Transmitted virus”, virus perjudicials o patògens per a l'ésser humà.

D'altra banda, aquests virus, a més de les transfusions de sang, poden ser introduïts a l'interior de l'ésser humà i transmesos de manera humana per mitjans relacionats amb la via parenteral: xeringues compartides, aparells comuns utilitzats en la realització de diàlisi, equips quirúrgics, etc. Algunes d'aquestes vies són, per tant, les que poden estar dins de l'hospital, i es diu que la gent que es contagia així és la que capta les infeccions nosocomials, ja que han inclòs la infecció dins de l'hospital i a més per la mateixa via. D'altra banda, també és possible la transmissió sexual i la transmissió de la mare al seu fill (l'anomenada transmissió vertical). Conèixer quin és el mecanisme de transmissió és, per tant, molt important per a tallar o eliminar aquesta via al més aviat possible.

Quant als mètodes de detecció, en el cas del CHB, la seva identificació es pot realitzar mitjançant proves serològiques, és a dir, mitjançant l'aparició o no d'anticossos, però aquesta informació no ens indica completament l'estat d'aquest virus, si es troba replicat activament. En el cas dels altres dos virus esmentats, en l'actualitat no hi ha proves serològiques o l'única que existeix (en el cas del GHB) no és del tot fiable. Per tant, és necessari buscar mètodes àgils i eficaços per a identificar aquests virus. En l'actualitat la via més ràpida són els mètodes que detecten el propi genoma. Per a això, mitjançant la tècnica de reacció encadenada de la polimerasa (PCR) s'amplifica una part del genoma i, posteriorment, es pot visualitzar la seqüència de nucleòtids d'aquesta part utilitzant el seqüenciador automàtic.

El seqüenciador ens permet llegir el mateix genoma i analitzar els genotips que apareixen en cada virus. Així mateix, la seqüenciació ens permet detectar canvis o mutacions en el genoma. D'aquesta forma es pot comprovar si els esmentats virus es muten o canvien quan estan dins del pacient o mesurar la variabilitat d'un pacient a un altre. Aquests canvis donen lloc a l'anomenada distància genètica entre virus interns dels pacients. Mitjançant l'ús de programes d'ordinador es poden construir arbres genètics que formin aquestes distàncies genètiques, observant de manera malaltissa la igualtat entre els virus. Com més a prop estigui el pacient en dos arbres genètics, més semblants seran els virus que es troben en el seu interior i el que pot deduir-se és si la via de transmissió o contaminació ha estat la mateixa, per exemple si la infecció nosocomial s'ha produït a través d'un aparell o si s'ha utilitzat la mateixa xeringa en els pacients per a administrar anestèsia, etc.

El nostre equip de treball, per tant, pretén desenvolupar mètodes d'identificació àgils dels virus CHB, GHB i TTV, i analitzar diferents grups de població (donants de sang, drogoaddictes intravenosos, hemodializados, amb hepatitis). Una vegada definides les taxes de prevalença dels tres virus esmentats en aquests grups del nostre territori i determinats els seus genotips, detectarem la variabilitat genètica dels virus de manera malalta. Si comparem els resultats en el nostre territori amb altres llocs internacionals, es pot determinar que existeix un genotip diferent geogràficament i molt més important, clínicament, per a poder buscar una relació entre genotip i clínica. Amb tots ells es pretén comprovar quines són les vies de transmissió o transmissió dels virus i confirmar l'existència d'infecció nosocomial. Aquesta informació servirà als metges i autoritats hospitalàries per a prendre les mesures preventives necessàries i eliminar aquestes vies de contaminació.