La seqüenciació d'ADN amb nanoporo dóna els seus primers resultats

2012/04/01 Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

• Teknologia
• Genetika

Els investigadors d'Oxford Nanopore Technologies han presentat els primers resultats obtinguts amb un dispositiu de seqüenciació d'ADN passant per un nanoporo. Segons ells, amb aquest dispositiu es podrà seqüenciar un genoma humà complet en 15 minuts.

La idea és antiga, dels 90. L'ADN es fa passar per un nanoporo proteic integrat en una membrana. A través del nanoporo flueix el corrent elèctric i cada base d'ADN produeix una variació diferent en aquest corrent. El mesurament d'aquests canvis permet conèixer la seqüència de l'ADN que passa pel nanoporo.

Aquesta tècnica té diversos avantatges. D'una banda, requereix molt menys treball preparatori de l'habitual; entre altres coses, no és necessari amplificar l'ADN, n'hi ha prou amb posar-lo en una solució. D'altra banda, seqüència i en temps real filaments molt més llargs que els seqüenciadors actuals. A més, no afecta a l'ADN seqüenciat i el deixa en condicions de realitzar més anàlisi.

La posada a punt de la tècnica ha trigat uns vint anys, però els d'Oxford ho han aconseguit: Amb la secuenciadora anomenada GridION, seqüencien el genoma del bacteriòfag Phi X. El llançament de GridION començarà a partir de la meitat de l'any, amb la intenció de comercialitzar una versió miniaturitzada (grandària USB) i barata (uns 700 euros) denominada MinION.

La primera versió de Gridion tindrà 2.000 nanoporos, però per a l'any vinent es preveu treure 8.000. A més, els dispositius es poden unir entre si i amb 20 dispositius de 8.000 nanoporos seria possible seqüenciar un genoma humà en 15 minuts.

No obstant això, el seqüenciador té un punt feble: Té un error del 4%, és a dir, llegeix incorrectament 4 de cada 100 nucleòtids. No obstant això, els investigadors assenyalen que l'objectiu és reduir aquest error de comercialització entre 0,1 i 1%.