Els investigadors de la UPV/EHU descodifiquen el transcriptor del korrokoi

2009/12/01 Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

• Genetika

El grup de recerca Biologia Cel·lular en Toxicologia Ambiental del Departament de Zoologia i Biologia Cel·lular de la UPV/EHU acaba de descodificar la transcripció del coco. Transcriptoma és la part que es transcriu o es llegeix del genoma. En la majoria dels éssers pluricel·lulars es troba al voltant del 1,5% del genoma.

Per a dur a terme aquest treball de recerca, els investigadors de la UPV/EHU van capturar en Ondarroa diversos exemplars de korrocoya. De cada exemplar es van separar diversos òrgans, com a fetge, brànquies, gònades, cervell, etc., dels que s'extraió l'ARN missatger. A continuació, tot el missatger d'ARN s'ha convertit en ADN addicional (cADN).

Tots aquests ADN addicionals van ser enviats al servei de seqüenciació de la Universitat de Newcastle. De fet, disposen d'un nou sistema de seqüenciació, molt ràpid i eficaç. D'aquesta manera, l'equip de recerca de la UPV ha obtingut tota la informació de la transcriptora del coco, 126 milions de nucleòtids.

"Després arriba el treball més cansat. Donar sentit a tota aquesta informació. És a dir, examinar a quin gènere correspon cada seqüència", afirma Ibon Cancio, director del projecte.

"Hem adquirit parts de 18.332 gens. No són tots els gens del corredor, però sí més de la meitat" afegeix Cancio. Amb tota aquesta informació han desenvolupat un microxip d'ADN que permet investigar com es modifica el nivell d'expressió de tots aquests gens davant la contaminació.

L'equip d'investigadors de la UPV-EHU espera descodificar la transcripció de la melsa l'any vinent per a conèixer l'estat de salut dels sòls.