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Le catalogue génétique des micro-organismes des estuaires de la côte basque a été achevé

Le premier catalogue génétique de sédiments des estuaires de la côte basque a été complété par une équipe de recherche internationale dirigée par l'AZT. Ce catalogue permet de connaître la biodiversité des micro-organismes vivant dans ces écosystèmes.

L'AZT explique qu'il s'agit de la première tentative systématique de caractériser génétiquement l'habitat des sédiments des estuaires à l'aide de techniques métagénomiques. Les travaux ont porté sur 92 échantillons de sédiments provenant de 12 estuaires. La métagénomique a identifié 108 millions de gènes et 471 génomes de micro-organismes (bactéries, archées, eucaryotes et virus).

Ce catalogue génétique permettra aux chercheurs d'étudier comment les micro-organismes maintiennent le fonctionnement des écosystèmes estuariens et réagissent aux pressions humaines. En effet, les informations génétiques recueillies permettront d'identifier les marqueurs associés à la pollution ou à la perte de qualité écologique.

Ils soulignent également que cette ressource fournit une base solide pour les applications de bioprospection et de biotechnologie, en permettant d'identifier les gènes qui pourraient être applicables dans des secteurs tels que l'énergie bleue, l'aquaculture ou l'industrie alimentaire.

Ainsi, les principales applications pratiques ont été citées: Développer des indices d'état écologique basés sur l'ADN, la biosurveillance portuaire pour la détection d'espèces envahissantes ou pathogènes, la gestion des activités de dragage et d'émission, le suivi du carbone bleu dans les estuaires, et le bionettoyage ciblé.

Conformément au principe de la science ouverte, tous les résultats de la recherche, séquences, annotations fonctionnelles et taxonomiques, ainsi que tous les génomes reconstitués, ont été mis à disposition dans les registres publics (ENA et BioStudies) afin de permettre à la communauté scientifique de les réutiliser dans ses recherches futures.