I ara, després del genoma, el proteoma

2001/04/06 Roa Zubia, Guillermo - Elhuyar Zientzia

• Genetika

El desig de vendre als mitjans de comunicació ha fet que s'hagin publicat moltes grandeses sobre el genoma humà. Però els qui entenen una mica de la química cel·lular ho van aconsellar repetidament. Conèixer el genoma no implica el control de la biologia humana. Per a aconseguir-ho, almenys, és necessari identificar les proteïnes que codifica el genoma, determinar la seva estructura i funcions i comprendre les interaccions entre les proteïnes. Malgrat tot això, serà difícil tenir un control complet.

Aprofitant la imatge actual de la ciència, algunes empreses han vist el camí d'enriquir-se. En el cas de Genoma, l'empresa Celera Genomics va oferir una magnífica exposició. Cada vegada que li interessava, amb l'ajuda dels mitjans que publicava, va seqüenciar tot el genoma humà. L'empresa Celera donava suport al sensacionalisme. Però encara que ho fem públic en tres ocasions, no oblidem que la seqüenciació del genoma encara no s'ha completat. Hi ha moltes dades disponibles però no s'ha completat.

Veient l'oportunitat, ara una empresa anomenada Myriad Genomics vol fer-se amb els avantatges del següent pas d'aquesta competència. Ha signat un acord amb Hitachi i Oracle per a crear un subsidiari anomenat Myriad Proteomics. La nova empresa unirà la tecnologia d'Hitachi, el programari d'Oracle i científics de Myriad per a realitzar l'estudi del proteoma humà.

Per a què servirà el proteoma?

Proteoma és un grup de proteïnes del cos que, en general, són molècules que realitzen reaccions químiques de la vida. La molècula que transporta oxigen en la sang i la que divideix la glucosa dins de la cèl·lula, determina quins compostos es poden introduir en les cèl·lules i molts altres són proteïnes. Hi ha molts exemples. Moltes malalties es produeixen pel fet que alguna proteïna no compleix bé el treball. Així doncs, tant en medicina com en biologia i química es produirien grans avanços si s'entén el funcionament del proteoma. Myriad és una empresa amb un objectiu de mercat, obtenir informació per al desenvolupament de nous medicaments.

El problema és que el proteoma humà està compost per moltes proteïnes. A més, és imprescindible saber amb què ha d'associar-se cada proteïna per a un treball adequat. Per a això, Myriad utilitzarà dues metodologies complementàries. Basant-se en l'exemple de l'empresa Celera volen posar en marxa un sistema de treball extremadament ràpid.

El primer d'aquests dos mètodes és el denominat ProNet. Es tracta d'una versió industrial de la cerca intermèdia dels dos híbrids de llevat. És un mètode que estudia les interaccions concretes entre proteïnes. Obté informació dels gens que s'activen conjuntament, identificant els punts d'activació en la cadena d'ADN. Aquest mètode no sempre té èxit, ja que identifica molts punts d'activació erronis. No obstant això, han aconseguit reduir l'error de l'última tecnologia del mètode fins a l'1%. També s'utilitzarà la tècnica ProSpec. Aquesta tècnica, basada en l'espectroscopía de masses, identifica els complexos de les proteïnes (grups de proteïnes en actiu).

De la mà de totes dues tècniques s'espera un ràpid estudi del proteoma. No obstant això, C. Segons el bioquímic Marc Vidal, que estudia el proteoma de la gusana Elegans, la quantitat d'informació que es pot obtenir en uns tres anys és molt elevada, però no és de tot el proteoma. Per això, el consell del científic és que no es facin anuncis impactants en la premsa. És una nota absolutament prudent. Però a la vista de la història del genoma, segurament no serà necessari demanar-lo.