Revisión xenoma mosca drosophila

2001/05/17 Roa Zubia, Guillermo - Elhuyar Zientzia

• Genetika

A empresa Celera Genomics, ademais do xenoma humano, secuenció e publicou o ano pasado o xenoma da mosca Drosophila Melanogaster. Agora, un grupo de científicos da Universidade de Stanford en California realizou unha análise do publicado.

A revista Nature publica hoxe as conclusións do estudo. Esta breve comunicación comeza coa seguinte reflexión: "Aínda que existen grandes consensos en moitas secuencias génicas, existen moitas discrepancias significativas".

A partir dos datos secuenciados, os de Celera Genomics trataron de predicir os xenes codificados. Anunciábase que a mosca de drosophila tiña 14.226 xenes, incluídos outros 550 que poderían existir en combinacións descoñecidas. Pero esta mosca foi moi utilizada nos laboratorios, polo que os bioquímicos do mundo almacenaron os datos recompilados durante anos nunha base de datos. Esta base de datos denomínase SwissProt. Os científicos de Stanford compararon estas dúas fontes de datos. Cabe destacar que estes científicos son matemáticos, expertos en bases de datos.

A comparación realizouse cunha mostra de 1.049 xenes tomados da base de datos SwissProt. Tan só o 26,2% dos xenes comparados cos datos da empresa eran idénticos. O 28,8% ten datos iguais en lonxitude pero modificados. O resto de xenes presentaba diferenzas significativas (superior ao 1%) nas secuencias especificadas en ambas as fontes.

Na base de datos SwissProt recompilouse un traballo de moito tempo, polo que moitas veces xa foi verificado. Este breve artigo da revista Nature cuestiona a fiabilidade da metodoloxía desenvolvida pola empresa. Segundo os autores, a utilización dos datos do xenoma de Drosophila limita considerablemente a investigación da proteoma e probablemente esta conclusión tamén servirá paira o caso do xenoma humano.