Revisió genoma mosca drosophila

2001/05/17 Roa Zubia, Guillermo - Elhuyar Zientzia

• Genetika

L'empresa Celera Genomics, a més del genoma humà, va seqüenciar i va publicar l'any passat el genoma de la mosca Drosophila Melanogaster. Ara, un grup de científics de la Universitat de Stanford a Califòrnia ha realitzat una anàlisi del publicat.

La revista Nature publica avui les conclusions de l'estudi. Aquesta breu comunicació comença amb la següent reflexió: "Encara que existeixen grans consensos en moltes seqüències gèniques, existeixen moltes discrepàncies significatives".

A partir de les dades seqüenciades, els de Celera Genomics van tractar de predir els gens codificats. S'anunciava que la mosca de drosophila tenia 14.226 gens, inclosos altres 550 que podrien existir en combinacions desconegudes. Però aquesta mosca ha estat molt utilitzada en els laboratoris, per la qual cosa els bioquímicos del món han emmagatzemat les dades recopilades durant anys en una base de dades. Aquesta base de dades es denomina SwissProt. Els científics de Stanford han comparat aquestes dues fonts de dades. Cal destacar que aquests científics són matemàtics, experts en bases de dades.

La comparació es va realitzar amb una mostra de 1.049 gens presos de la base de dades SwissProt. Tan sols el 26,2% dels gens comparats amb les dades de l'empresa eren idèntics. El 28,8% té dades iguals en longitud però modificats. La resta de gens presentava diferències significatives (superior a l'1%) en les seqüències especificades en totes dues fonts.

En la base de dades SwissProt s'ha recopilat un treball de molt de temps, per la qual cosa moltes vegades ja ha estat verificat. Aquest breu article de la revista Nature qüestiona la fiabilitat de la metodologia desenvolupada per l'empresa. Segons els autors, la utilització de les dades del genoma de Drosophila limita considerablement la recerca de la proteoma i probablement aquesta conclusió també servirà per al cas del genoma humà.