Simulez un virus par ordinateur
2006/06/01 Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria
L'Université de l'Illinois (USA) a effectué une simulation détaillée d'un virus par ordinateur. Ce qu'ils ont imaginé a été un petit ARN --virus satellite de mosaïque de tabac, avec environ un million d'atomes. Grâce à un logiciel appelé NAMD, ils ont pu analyser chacun de ces atomes.
Le programme NAMD permet de simuler des molécules biologiques avec un grand succès. Le programme met en place des centaines d'ordinateurs parallèles pour compléter les calculs d'un ordinateur domestique pendant 35 ans dans un temps acceptable. On a analysé 50 milliards d'images pour chaque seconde de la vie du virus (10-15 secondes). La simulation révèle que même si le virus est symétrique, il a des pulsations irrégulières et une forme de reproduction rare.
Des simulations de virus plus grands et des systèmes biologiques plus complexes ainsi que des simulations plus longues devraient être réalisées à l'avenir. Mais pour cela, ils devront attendre la nouvelle génération d'ordinateurs, qu'ils espèrent venir dans environ cinq ans.
