Computadores e bioloxía: un alimenta ao outro

2003/02/20 Carton Virto, Eider - Elhuyar Zientzia

• Hardwarea

Cada ano, en homenaxe a Alan Tuning, pioneiro no mundo dos computadores, celébrase a Conferencia de Tuning. Este ano a charla foi impartida por Carol Kovac de IBM. Kovac é o xefe do departamento de Ciencias da Vida en IBM e falou sobre o seu tema, a relación entre a bioloxía e os computadores. E, de paso, anunciou o próximo computador de IBM.

Kovac observa grandes similitudes no desenvolvemento de ambas as áreas. Nos últimos anos, considera que a bioloxía se está achegando á lei de Moore. A lei de Moore predí que a capacidade dos chips aumenta exponencialmente e duplícase cada 18 meses. "Os bioinformáticos piden máis capacidade que nunca aos computadores e, por tanto, aos autores dos computadores, o que vai guiar o desenvolvemento dos computadores", afirmou Kovac. Precisamente, una das súas tarefas é a procura de socios paira realizar investimentos nesta liña.

Co obxectivo de investigar no campo da bioloxía e sobre todo no xenoma, IBM comercializará o computador Blue Gene. Este computador será capaz de realizar 360.000 millóns de operacións por segundo, máis das 500 mellores supercomputadoras dispoñibles na actualidade. Blue Xene contará con 65.536 procesadores en parellas que traballan paralelamente e consumirá 20 Quilowatts por hora. En relación custo/resultado, Deep Blue será 20 veces mellor que o pioneiro. Deep Blue, cando naceu, contaba con 256 procesadores e podía operar entre 100 e 200 mil millóns. Paira referirse, os computadores convencionais teñen un procesador, dous, catro, oito.

Kovac cre que as posibilidades de xestionar e analizar a información xenética con este tipo de computadores multiplicaranse, e que o coñecemento que diso se derive impulsará o seu traballo. Os clientes.

Kovac tamén abordou o formato máis adecuado paira xestionar toda esta información. Veo ao formato XML de grandes futuros. Actualmente utilízase moito en Internet e pola súa natureza pode ser moi apropiado paira a xestión de datos xenéticos, ten código aberto e é gratuíto.