Ordinadors i biologia: un alimenta a l'altre

2003/02/20 Carton Virto, Eider - Elhuyar Zientzia

• Hardwarea

Cada any, en homenatge a Alan Tuning, pioner en el món dels ordinadors, se celebra la Conferència de Tuning. Enguany la xerrada ha estat impartida per Carol Kovac d'IBM. Kovac és el cap del departament de Ciències de la Vida en IBM i ha parlat sobre el seu tema, la relació entre la biologia i els ordinadors. I, de pas, ha anunciat el pròxim ordinador d'IBM.

Kovac observa grans similituds en el desenvolupament de totes dues àrees. En els últims anys, considera que la biologia s'està acostant a la llei de Moore. La llei de Moore prediu que la capacitat dels xips augmenta exponencialment i es duplica cada 18 mesos. "Els bioinformáticos demanen més capacitat que mai als ordinadors i, per tant, als autors dels ordinadors, la qual cosa guiarà el desenvolupament dels ordinadors", ha afirmat Kovac. Precisament, una de les seves tasques és la cerca de socis per a realitzar inversions en aquesta línia.

Amb l'objectiu d'investigar en el camp de la biologia i sobretot en el genoma, IBM comercialitzarà l'ordinador Blue Gene. Aquest ordinador serà capaç de realitzar 360.000 milions d'operacions per segon, més de les 500 millors supercomputadoras disponibles en l'actualitat. Blue Gen comptarà amb 65.536 processadors en parelles que treballen paral·lelament i consumirà 20 Kilowatios per hora. En relació cost/resultat, Deep Blue serà 20 vegades millor que el pioner. Deep Blue, quan va néixer, comptava amb 256 processadors i podia operar entre 100 i 200 mil milions. Per a referir-se, els ordinadors convencionals tenen un processador, dos, quatre, vuit.

Kovac creu que les possibilitats de gestionar i analitzar la informació genètica amb aquesta mena d'ordinadors es multiplicaran, i que el coneixement que d'això es derivi impulsarà el seu treball. Els clients.

Kovac també va abordar el format més adequat per a gestionar tota aquesta informació. Ho veu al format XML de grans futurs. Actualment s'utilitza molt en Internet i per la seva naturalesa pot ser molt apropiat per a la gestió de dades genètiques, té codi obert i és gratuït.