Técnica de elaboración más rápida del mapa genético

2001/06/11 Galarraga Aiestaran, Ana - Elhuyar Zientzia

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Para la búsqueda de genes relacionados con enfermedades, los investigadores utilizan habitualmente ratones de laboratorio, que proporcionan mediciones más nítidas que los humanos. Al crecer cientos o miles de ratones buscan indicadores genéticos relacionados con características como la obesidad o el alto nivel de colesterol. Los modelos de asociación permiten identificar determinadas partes del genoma del ratón asociadas a la característica. La consecución de este resultado, sin embargo, es un trabajo muy pesado y largo que requiere de años para conocer la situación aproximada de un gen.

Ahora, Gary Peltz y su equipo han presentado la forma de acelerar el proceso. Los investigadores recogieron en 15 variedades de ratón una base de datos con 3.000 indicadores genéticos denominados polimorfismos mononucleótidos (SNP). Posteriormente se inventó un algoritmo para localizar las características. Para ello, los investigadores buscaron una característica concreta en cada variedad de ratón (por ejemplo, el nivel de colesterol) y vieron cómo variaba según la variedad. Posteriormente, el algoritmo analizó los pares de variedades y buscaba los mismos modelos de SNP entre los fenotipos similares. A mayor variedad de variedades analizadas, mayor predicción.

Para probar la eficacia del algoritmo se introdujeron en el programa datos de 10 características conocidas, entre ellas la densidad ósea y la tendencia al consumo de alcohol. Posteriormente, se compararon los espacios proporcionados por el ordenador con el mapa obtenido con el método tradicional y se observó que coincidían en un 75%.

Este resultado aún no es tan satisfactorio como se esperaba, por lo que seguirán trabajando en su mejora. Sin embargo, creen que algún día servirá para localizar rápidamente mutaciones que explican las diferencias entre los fenotipos.